日本共有9所高校进入本次世界大学排行榜的Top200。排名最高的东京大学位列第23位，较去年有所进步。京都大学位列第35位。
以下是进入2019QS世界大学排名Top200排行榜的日本大学榜单：
| 2019排名 | 2018排名 | 机构名称 |
| 23 | 28= | 东京大学 The University of Tokyo |
| 35 | 36= | 京都大学 Kyoto University |
| 58 | 56 | 东京工业大学 Tokyo Institute of Technology |
| 67 | 63 | 大阪大学 Osaka University |
| 77 | 76= | 东北大学 Tohoku University |
| 111 | 116= | 名古屋大学 Nagoya University |
| 126= | 128 | 九州大学 Kyushu University |
| 128= | 122= | 北海道大学 Hokkaido University |
| 198 | 192= | 庆应义塾大学 Keio University |
