1.核小体结构？
2.核糖体活性位点？
3.DNA二级结构？
4.原核生物与真核生物基因组的差异
5.维持DNA双螺旋稳定性因素？
6.原核生物中的DNA聚合酶(大肠杆菌）
7.真核生物的RNA聚合酶Ⅱ的启动子结构特点？
8.转座发生的机制、类型、遗传学效应
9.证明遗传物质是核酸的实验依据是什么？
10.设计实验证明DNA的半保留复制？
11有何机制确保DNA复制的忠实性？
12.原核生物（以大肠杆菌为例）DNA复制起始的步骤？
13.简述原核生物转录起始的过程。
14.大肠杆菌有两种类型的终止子（原核生物转录终止的两种机制
15.比较原核真核转录的差异。
16.增强子的特点
17.真核生物转录后加工？
18.原核生物翻译起始过程？
19.真核生物翻译后加工。
20.细菌与真核生物RNA翻译的机理的
21.延伸因子的种类及作用机制？
22.蛋白质合成的延伸步骤。
23.蛋白质后包括哪些方面。
24.简述真核生物核基因mRNA剪接的机制。
25.真核生物基因表达调控的主要控制点有哪些？
26.原核生物的基因表达调控分为几个层次。
27.真核生物基因表达调控的层次与方式。
28.真核生物和原核生物在基因表达调控上有以下几点不同
29.什么是原核生物的正调控和负调控。
30.正调控和负调控的主要不同。
31.大肠杆菌链前导链和滞后链的协同合成。
32.启动子的作用是什么，原核生物启动子的结构。
33.TBP在三种真核RNA聚合酶的转录起始中的。
34.为什么说RNA编辑是中心法则的。
35.为什么说σ因子的更替可对转录进行调控。
36.Trapoxin是组蛋白去乙酰化酶的抑制剂。你认为该抑制剂对转录的影响是什么，为什么？
37.可变剪接调控机制
38.反式作用因子与顺式作用元件的相互作用存在于基因表达的各个水平上。请分别举例说明：⑴DNA复制起始⑵转录起始和⑶翻译起始过程中二者的相互作用。
39.真核生物反式作用因子的功能域及其与DNA结合基序有哪些？
40.真核生物的顺式作用因子和反式作用因子如何相互作用来调控基因的转录
41.弱化子的作用机理？
42.以色氨酸操纵子为例，论述原核生物基因表达的阻抑作用和弱化作用的机制（见上题）
43.以大肠杆菌为例，说明色氨酸操纵子的特点和机制及乳糖操纵子的机制
44.葡萄糖代谢是如何调控乳糖操纵子表达的？

1.核小体的结构？
①由核心颗粒和连接区构成；
②核心颗粒包括由8个组蛋白分子（H2A，H2B，H3，H4各两个）构成的组蛋白核心和包绕在核心表面的DNA分子；
③包绕在组蛋白核心表面的DNA长140bp，环绕1 ¾圈；
④连接区由DNA分子和H1组蛋白分子构成，长度不定；
2.核糖体活性位点？
①mRNA结合位点：结合mRNA和IF因子
②P位点：结合fMet-tRNA和肽基-tRNA
③A位点：结合氨酰基-tRNA
④E位点：结合脱酰tRNA
⑤肽酰基转移酶：将肽链转移到氨基酰-tRNA
⑥EF-Tu结合位点：氨基酰-tRNA的进入⑦EF-G结合位点：移位 
3.DNA的二级结构？
1953年，Watson和Crick提出DNA的反向平行右手双螺旋结构模型。
要点:
①主链：脱氧核糖和磷酸通过3’,5’磷酸二酯键交互连接，成为螺旋链的骨架。两条链方向以反向平行的方式组成右手双螺旋。
②碱基对：只有A和T配对，G和C配对才能满足正常螺旋（直径20 Å ）的要求和chargaff的当量规律。
③螺旋参数：每个螺距为34Å ，其中含有10个核苷酸。
④大沟和小沟:对于遗传上有重要功能的蛋白质识别DNA双螺旋结构上的特定信息是非常重要的。
⑤氢键 配对碱基之间能够形成氢键，而同一条链中的相邻碱基形成一种碱基堆积力。两种力量的协同作用维持了双螺旋结构的稳定性。
4.原核生物与真核生物基因组的差异
①原核生物比真核生物基因数目少。
②原核生物基因组是连续的，即不含内含子，而真核生物的基因是不连续的额，由内含子和外显子相间排列，而且非编码序列多于编码序列。
③原核生物基因组有单个复制起点，为单复制子结构，真核生物基因组有多个复制起始点，为多复制子结构。
④原核生物基因组极少有重复序列，为单拷贝，真核生物有许多重复序列，多拷贝。
⑤原核多顺反，真核单顺反子
5.维持DNA双螺旋稳定性的因素？
①氢键 GC之间有三条氢键，AT之间有两条氢键，这是DNA双螺旋结构的重要特征之一，DNA的许多物理性质如变性、复性以及Tm值等都与此有关。
②碱基堆积力  碱基堆积作用对维持DNA的二级结构起着主要作用，它是碱基对之间在垂直方向上的相互作用。它包括：疏水作用、范德华力等。
③带负电荷的磷酸基的静电斥力 DNA溶液中的离子浓度降低时，阳离子在磷酸基周围形成的屏蔽作用减弱，使得磷酸基地静电斥力增大，因而Tm值随之降低。所以纯蒸馏水中的DNA在室温下就会变性。
碱基分子内能 温度升高，碱基分子内能增加时，碱基的定向排列遭受破坏，削弱了碱基的氢键结合力和碱基的堆集力，会使DNA的双螺旋结构受到破坏。
总之，氢键和碱基堆集力有利于DNA维持双螺旋结构，而静电斥力和碱基分子内能则不利于DNA维持双螺旋结构。
6.原核生物中的DNA聚合酶(大肠杆菌）
⑴DNA聚合酶Ⅰ是一个多功能酶，它可以催化以下的反应：
①DNA链沿5’ → 3’方向的延长（DNA聚合酶活性）。
②从3’端水解DNA链（3’ → 5’外切核酸酶活性）。
③从5’端水解DNA链（ 5’ →  3’ 外切核酸酶活性）。
功能：主要是对DNA损伤的修复；以及在DNA复制时切除RNA引物并填补其留下的空隙。
⑵DNA聚合酶Ⅱ
①活性很低，只有DNA聚合酶Ⅰ的5％。
②也以4种脱氧核糖核苷酸为底物，从5’-3’方向合成DNA
③具有3’-5’外切核酸酶活性，但无5’-3’外切酶活性。
功能：修复紫外光引起的DNA损伤
⑶DNA聚合酶Ⅲ①
①真正负责大肠杆菌细胞内合成DNA的复制酶。
②是多亚基组成的蛋白质。
③至少含有3种重要的酶活性。即5’-3’ DNA 聚合酶活性、3’-5’ 外切核酸酶活性和依赖DNA的ATP酶活性。不具有5-’3’外切核酸酶活性。
功能：DNA 复制的主要聚合酶，还具有3’-5’ 外切酶的校对功能，提高DNA复制的保真性。
7.真核生物的RNA聚合酶Ⅱ的启动子结构特点？
RNA聚合酶Ⅱ的启动子位于转录起始点的上游，由多个短的序列元件组成，主要有三个保守序列：
②    帽子位点，又称转录起始位点，其碱基大多数为A，这与原核生物相似。
②TATA框， 位于－30处，又称Hogness框。一致序列TATAA（T）AA（T）。有些TATA框的突变不影响转录的起始，但可以改变转录起始位点。说明TATA框具有定位转录起始点的功能。
③CAAT框， 位于－75处，一致序列为GGC（T）CATCT。CAAT框内的突变对转录起始的影响很大，决定了启动子起始转录的效率及频率。 另外还有GC框（GC box）、八聚核苷酸元件（octamer element）等元件。
8.转座
（1）机制：在靶DNA上制造一个交错的切口，然后转座子与突出的单链末端相连接，并填充切口。
（2）类型：复制型转座、非复制型转座、保守型转座
（3）遗传学效应：①转座引起插入突变②转座产生新的基因③转座产生染色体畸变④转座引起生物进化。
9.证明遗传物质是核酸的实验依据是什么？
①1928年，英国细菌学家Frederick Griffith肺炎链球菌转化实验表明活的无毒R型细菌从死去的有毒S型菌得到了一些什么东西从而使无毒的R型转化成有毒的S型肺炎球菌。
②1944年，Avery等体外转化实验用有机溶剂去除蛋白、用胰蛋白酶（trypsin）和胰凝乳蛋白酶（chymo-trypsin）消化蛋白对转化没有影响，但DNA酶消化使转化作用不能发生。说明转化源是DNA。
③1952年，美国冷泉港实验室Hershey和ChaseT2噬菌体侵染实验确证了DNA是遗传物质。他们用32P和35S分别标记噬菌体的DNA和蛋白质，发现只有DNA进入宿主细菌内，而蛋白质则没有。
④1956年A.Gierer和G.Schraman烟草花叶病毒TMV重建实验证明RNA也是遗传物质。
10.设计实验证明DNA的半保留复制？
实验方法;将大肠杆菌在15N为唯一氮源的培养基中进行培养，然后将其转入以14N为氮源的培养基中培养，采用氯化铯密度梯度离心，观察各代培养物的DNA形成区带的位置和比例，根据实验结果对DNA复制的过程进行分析。
①将大肠杆菌长期在以15N为唯一氮源的培养基中培养，得到15N-DNA-CsCl密度梯度
②用14N为氮源的培养基培养15N标记的大肠杆菌，经过一代以后，氯化铯密度梯度离心形成一条带，但密度在14N-DNA和15NDNA之间，即形成杂合分子14N-15N
③两代后，DNA形成两条带，一条带在14N-DNA和15NDNA之间，另一条在14N-DNA上
④三代后，DNA也形成两条带，位置与子二代相同，但14N-DNA带变宽。
11.有何机制确保DNA复制的忠实性？
复制过程的忠实性是保证生物体遗传信息准确传递的一个必要条件，它取决于碱基配对的专一性。
①DNA聚合酶可以通过两种方式提高互补碱基选择的专一性。第一，通过专一性识别使即将加入的碱基与模板的碱基严格互补，这种方式用来控制合成前的错误。第二，当发现存在着错配碱基时，可切除新加入的碱基，这种方式叫校对控制。两种方式既可单独起作用，也可共同起作用。
②复制过程中碱基配对受双重核对作用控制：聚合酶的选择作用和3’-5’外切核酸酶的校正（proofreading）作用。
③    不同的聚合酶以不同的方式处理聚合与校对的关系。
④DNA聚合酶在复制过程中造成的错误除了不正确配对造成的核苷酸取代外，还包括由于插入或缺失额外的核苷酸造成的框架移位。
12.原核生物（以大肠杆菌为例）DNA复制起始的步骤？
复制起始点
       DNaA蛋白识别并结合复制起始点
       DNaA蛋白使DNA解旋
       DNaB在DNaC的作用下组装到OriC上
预引发体形成
       复制复合物改型
       DNaC蛋白从预引发体上脱离
DNaB螺旋酶活化
       螺旋酶解旋DNA
       引发酶加入
引发体形成
       引物合成
       β滑动钳结合到引发的DNA上
       全酶组装
复制体形成，开始DNA合成
13.简述原核生物转录起始的过程？
①全酶与模板的DNA接触，生成非专一的,不稳定的复合物在模板上移动；
②起始识别：全酶与－35序列结合，产生封闭的酶-启动子二元复合
③全酶紧密地结合在-10序列处，模板DNA局部变性，形成开放的启动子二元复合体；
④第一个rNTP转录开始,形成酶-启动子-rNTP三元复合体（ternary complex）。
⑤当RNA长约9bp形成稳定的DNA-酶-RNA 复合物、 σ因子释放，结束起始，进入延伸阶段。σ因子释放是起始与延伸的分水岭
14.大肠杆菌有两种类型的终止子（原核生物转录终止的两种机制）
①依赖ρ因子的终止子：依赖ρ因子的终止子必须在ρ因子的存在下才能终止核心酶的转录作用。具有使DNA-RNA杂交体解链的作用。它追赶上RNA聚合酶后使DNA-RNA解链，释放RNA聚合酶，使转录终止。
②不依赖ρ因子的终止子：只有核心酶和终止子就足以使转录终止，不依赖其他其他辅助因子的作用。不依赖ρ因子的终止子在结构上有两个特征，一个是转录生成的RNA形成发夹结构，二是发夹结构末端紧跟着6个连续的U串。RNA聚合酶在发夹结构处被终止， 6个连续的U串可能为RNA聚合酶与模板的解离提供了信号。