国内流通企业遇到的问题还有上下游协作的障碍。供应链管理要求打破了原有的结构和边界，价值链上的各环节必须做到紧密协作，信息共享。而供应链里可能有几十甚至上百家的企业，公司之间的协作是一件非常困难的事情。在我国传统的商业模式中，供应商、制造商、经销商和零售商是完全独立的，在互为供需的基础上，形成各自的闭环结构，他们往往把自己获得的信息和数据作为商业机密独享，没有实现最大的利用。
　　如何构建高效的供应链系统
　　有远见的流通企业已经开始重构他们的供应链系统。供应链上最优秀的成员将依靠知识与创新能力来获取竞争优势，而不是靠规模和地位。力争成为供应链领导者的公司必须能够做到：了解消费者和市场，与供应链其他成员分享交流并运用这些信息，在组织内部和供应链内部建立和发展以市场为导向的机制，为供应链建立目标。以下我们从五个方面来看流通企业如何构建一个高效的供应链系统：
　　建立以市场为导向的经营理念。供应链管理最重要的驱动力还是客户的需求，整个供应链不是从生产开始，而是从客户的需求开始。首先要了解消费者的想法，了解消费者想买什么，怎样买，为什么买，然后根据这些信息去开发受欢迎的产品。如戴尔计算机公司完全以客户为中心来合理地管理整个供应链。因此，供应链中，产品并不一定要由制造商来开发，而可以是链上的任何环节。比如李宁公司是品牌经营者，承担了 “李宁”品牌产品的设计，但其制造工作只有不到10%是由自己来完成。
　　建立基于供应链的协作商务。基于供应链的协同商务是企业供应链管理的核心。供应链中的四个关键环节：原材料供应商、生产厂家、分销商和零售商联结起来，供应链成员与上下游企业共同承担流通环节的风险、充分顾及合作伙伴的合理利润，对新产品的开发和生产计划以及分销进行严格的引导，互相参与对方的决策，各方共同努力，集中各环节的资源取得整体最优的回报。
　　协同商务模式先从战略供应商着手，只要提高主要供应商的效率，就可产生所期望的收益。资源允许的情况下，可延伸到较小的供应商。接下来要纳入协同商务的是从供应商到制造商，再到分销商和零售终端。很显然，协同商务模式要求供应链各环节分享关键信息，整个供应链在跨企业的信息平台上运作。如果共享这些信息，供应链成员可以同时对市场变化作出反应，而不需要自下而上逐级反馈，为竞争赢得了宝贵的时间，也减少了库存积压的风险，同时满足最终用户的需求。
　　建立满足供应链的组织结构和业务流程。为了使供应链高效运转，首先要建立高效的业务流程和合理的组织结构。业务流程重组包括在供应链范围内和在单个企业范围内。通过供应链范围内的业务流程重组，要沿着供应链转移职能，确定哪个公司最适合完成哪项任务，并明确改进工作的方法。目标是优化供应链，使产品能尽快推向市场。流程的调整使企业之间的协作关系更清晰明确，为实现真正的协同商务打下坚实的基础。另外，销售渠道的的主要发展趋势之一是渠道扁平化，涉及到单个流通企业内部和外部的流程调整。
　　建立高效的物流体系。物流管理水平已成为了衡量一个流通企业管理水平的关键标准。物流包括从供应链源头到消费终端的每一生产阶段的采购、存储、运输和交付。物流管理的目的在于两点：成本和服务。
　　为了在流通企业内部建立高效的物流体系，常常把采购、物料管理、仓储、运输、存货管理和配送部门置于一个高层经理的管理下。这个职能组的主要构成是原材管理和实物分配管理。积极去发现和消除物流中最薄弱的环节。
　　IT技术的运用。随着涉及的资源和环节的增加，对供应链的管理就会变得十分复杂，企业分销渠道宽度和深度的不断增加，作为制造者、品牌拥有者或供应商的企业总部，对产品的销售数据、市场分析以及资金回笼等情况却越来越难以掌控。信息技术成为监控所有环节的重要条件之一。
　　对于那些分支机构遍布全国的分销型企业而言，利用信息技术和互联网的发展，监控分公司、办事处、销售代表、代理商乃至门店、专柜已成为迫在眉睫的一项信息工程。正是由于信息技术的发展，物流系统和供应链管理水平得到空前的发展。行业内应用的IT系统包括ERP企业资源计划系统、SCM供应链管理系统、商品运输追踪系统、WMS仓库管理系统、GPS卫星定位系统、DRP分销资源管理系统、CRM客户关系管理系统、BI商业智能系统等。这些IT系统全面支持流通企业高速、规模化地发展，赢得了竞争优势。