公共卫生学院是1995年12月在原预防医学系基础上建立的，它的前身可追溯到1941年5月江苏医学院成立的公共卫生学系。公共卫生学院原设有11个教研室，为培养适应21世纪经济和社会发展需要的预防医学优秀人才，学院在1999年重组了"职业医学与环境卫生学系"（劳动卫生与职业病学、环境卫生学、卫生毒理学和卫生学教研室）、"营养与食品科学系"（营养与食品卫生学、卫生化学、妇幼卫生学、儿少卫生学教研室）、"流行病与卫生统计学系"（流行病学、卫生统计学、社会医学）和预防医学教学中心；2002年9月起调整设立了卫生检验学系，2003年成立了公共卫生突发事件咨询服务与研究中心，因此，学院目前的建制为四个学系和两个中心。
学院现有教职员工99人，其中学校在编教职工79人，高级职称者近50％，85%为中青年骨干教师。全院现有万元以上大型仪器设备40余台件，仪器设备总固定资产约1500万元，能满足教学和研究工作需要。
现有5个本科招生专业方向（预防医学、营养与食品卫生学、妇幼卫生学、卫生检验学、生物统计学）；6个硕士点（劳动卫生与环境卫生学、流行病与卫生统计学、卫生毒理学、营养与食品卫生学、卫生事业管理、儿少卫生与妇幼保健学）；3个博士点（劳动卫生与环境卫生学、卫生毒理学、流行病与卫生统计学）；2001年被国务院学位办批准为全国首批公共卫生硕士（MPH）招生试点单位；2003年国家人事部批准在我院设立公共卫生与预防医学博士后科研流动站。
江苏省和各省辖市疾病预防控制中心及卫生监督所均是学院本科生和MPH教学基地。仪征化纤职工医院（我校第三附属医院）、仪征市人民医院、南京江北人民医院、南京六合人民医院、扬中市人民医院和靖江市人民医院等是学院本科生临床实习基地。
2000年，劳动卫生与环境卫生学科被遴选为江苏省重点学科；2002年，流行病与卫生统计学和营养与食品卫生学两个学科被列为校级重点学科。现设有江苏省应用毒理学重点实验室和江苏省公共技术服务平台-江苏省医药、农药、兽药安全性评价与研究中心等两个省级重点实验室，并与学校生殖医学省重点实验室一起组建成立了科技部-江苏省共建重点实验室—江苏省人类生殖调控与危害评估重点实验室。还设有应用毒理学研究所、营养与食品科学技术研究所、卫生分析检测中心、公共卫生突发事件咨询服务与研究中心等4个校级研究所（中心），以及南京医科大学与哈佛大学公共卫生学院生态遗传与临床流行病学合作研究中心、南京医科大学与日本蜂乃宝株式会社合作研究中心等2个中外合作研究中心。1995年6月，公共卫生学院成为中国预防医学科学院（现中国疾病预防控制中心）江苏分院的重要组成单位之一。
近三年来学院参加国家重点基础研究（“973”）项目子课题4项，国家“863”项目子课题1项；主持国家自然科学基金项目14项，其他部省级科研项目30多项；科技服务项目年均200项以上。已在职业医学与环境卫生学、卫生毒理学、营养与食品卫生学、流行病学与卫生统计学等方面形成较好特色，并在保健食品、"三药"（医药、农药和兽药）的安全性评价方面为社会服务取得较好的社会效益和经济效益。
学院现有教职员工99人，其中学校在编教职工79人，高级职称者近50％，85%为中青年骨干教师。全院现有万元以上大型仪器设备40余台件，仪器设备总固定资产约1500万元，能满足教学和研究工作需要。
现有5个本科招生专业方向（预防医学、营养与食品卫生学、妇幼卫生学、卫生检验学、生物统计学）；6个硕士点（劳动卫生与环境卫生学、流行病与卫生统计学、卫生毒理学、营养与食品卫生学、卫生事业管理、儿少卫生与妇幼保健学）；3个博士点（劳动卫生与环境卫生学、卫生毒理学、流行病与卫生统计学）；2001年被国务院学位办批准为全国首批公共卫生硕士（MPH）招生试点单位；2003年国家人事部批准在我院设立公共卫生与预防医学博士后科研流动站。
江苏省和各省辖市疾病预防控制中心及卫生监督所均是学院本科生和MPH教学基地。仪征化纤职工医院（我校第三附属医院）、仪征市人民医院、南京江北人民医院、南京六合人民医院、扬中市人民医院和靖江市人民医院等是学院本科生临床实习基地。
2000年，劳动卫生与环境卫生学科被遴选为江苏省重点学科；2002年，流行病与卫生统计学和营养与食品卫生学两个学科被列为校级重点学科。现设有江苏省应用毒理学重点实验室和江苏省公共技术服务平台-江苏省医药、农药、兽药安全性评价与研究中心等两个省级重点实验室，并与学校生殖医学省重点实验室一起组建成立了科技部-江苏省共建重点实验室—江苏省人类生殖调控与危害评估重点实验室。还设有应用毒理学研究所、营养与食品科学技术研究所、卫生分析检测中心、公共卫生突发事件咨询服务与研究中心等4个校级研究所（中心），以及南京医科大学与哈佛大学公共卫生学院生态遗传与临床流行病学合作研究中心、南京医科大学与日本蜂乃宝株式会社合作研究中心等2个中外合作研究中心。1995年6月，公共卫生学院成为中国预防医学科学院（现中国疾病预防控制中心）江苏分院的重要组成单位之一。
近三年来学院参加国家重点基础研究（“973”）项目子课题4项，国家“863”项目子课题1项；主持国家自然科学基金项目14项，其他部省级科研项目30多项；科技服务项目年均200项以上。已在职业医学与环境卫生学、卫生毒理学、营养与食品卫生学、流行病学与卫生统计学等方面形成较好特色，并在保健食品、"三药"（医药、农药和兽药）的安全性评价方面为社会服务取得较好的社会效益和经济效益。