东南大学公共卫生学院位于东南大学丁家桥校区，原中央大学医学院的故址，毗邻风光秀丽的玄武湖和南京市中心商业区----湖南路，学院成立于1976年，原为南京铁道医学院预防医学系，1999年更名为公共卫生学院，2000年4月，原南京铁道医学院与东南大学合并，公共卫生学院成为东南大学下属的二级院系之一。
公共卫生学院在过去几十年的办学过程中，主要面向全国铁路系统，培养铁路卫生防疫工作需要的专门人才，并重点围绕铁路运输开展预防医学科研工作 ，在全国铁路卫生系统有广泛的影响。并入教育部直属的重点大学------东南大学之后，学院秉承百年名校的先进的办学理念，依托文理管工医多学科交融的雄厚资源，使学院的发展步伐进一步加快。
目前公共卫生学院设有预防医学（五年制）、劳动与社会保障（医疗保险方向、四年制）二个本科专业，共有在校本科生550名。预防医学专业现有1个博士点：劳动卫生与环境卫生学、6个硕士点：劳动卫生与环境卫生学、流行病与卫生统计学、营养与食品卫生学、分析化学、卫生毒理学以及公共卫生硕士（MPH）；劳动与社会保障专业现有1个硕士点：社会保障（医疗保险方向），也是国内最早开设（1995年）并最先拥有硕士授予权的专业。目前学院共有在校博士、硕士研究生近100名（不包括MPH）。
学院现设有4个系：劳动卫生与环境卫生学系、流行病与卫生统计学系、营养与食品卫生学系、医疗保险学系，三个研究所：预防医学研究所、铁路站车卫生研究所、医疗保险研究所、应用技术研究所，一个实验中心，并设有卫生部保健功能食品检测中心、铁道部爱滋病检测中心，有二个部级重点学科、二个部级开放性实验室。
学院现有在职教职工60余人，其中专任教师48人，教师中，教授11人（博导3人）、副教授19人，包括国务院特殊津贴获得者、省部级突出贡献奖获得者、省“333工程”入选者等，此外还在国内外聘请了一批著名的专家学者担任学院的兼职教授、博硕导师。目前全院95%以上的教师具有硕士以上学位，其中25%左右具博士学位。 学院有教学实验用房面积6000多平方米，教学科研仪器设备总值近1500万元。其中各种大型检测仪器设备比较齐全，实验室设施标准规范，为教学科研和学生的学习提供了良好的条件。近几年来学院年均到位科研经费300万元，开展了包括国家自然基金、省部级重点课题的研究。
学院广泛开展国内外合作与交流，每年都派出教师到国外大学、研究所进行学术交流或深造，并接待国内外同行来院交流访问。