| 院系代码 | 院系名称 | 信息发布网址 | 邮箱 | 联系电话 |
| 001 | 基础医学院 | http://basic.cqmu.edu.cn/ | 879405042@qq.com | 023-68485958 |
| 002 | 第一临床学院 | http://www.hospital-cqmu.com/gzb/yxjy/yjsjy.htm | 2996643699@qq.com | 023-89012704 |
| 003 | 第二临床学院 | https://www.sahcqmu.com/index.php?c=category&id=64 | yjsc2013@126.com | 023-62888245 |
| 004 | 儿科学院 | http://keshi.chcmu.com/k/ekxy/ | chcmuyjszs@163.com | 023-63313221 |
| 005 | 口腔学院 | http://www.cqdent.com/html/zsjy/ | cykqyxyyjs@126.com | 023-88602319 |
| 006 | 第五临床学院 | https://www.ychcqmu.com/ | 851857224@qq.com | 023-85381616 |
| 007 | 检验医学院 | https://jyx.cqmu.edu.cn/ | jianyan@cqmu.edu.cn | 023-68485240 |
| 008 | 公共卫生与管理学院 | https://gwgl.cqmu.edu.cn/ | ggxy@cqmu.edu.cn | 023-68485778 |
| 009 | 药学院 | https://yxy.cqmu.edu.cn | 289089073@qq.com | 023-68485161 |
| 010 | 生物医学工程学院 | https://swyxgcxy.cqmu.edu.cn/index.htm | 1263360159@qq.com | 023-68485023 |
| 011 | 中医药学院 | https://zyy.cqmu.edu.cn/xwgg/ggxx.htm | 1411579045@qq.com | 023-63702139 |
| 021 | 附属永川中医院 | 568174279@qq.com | 15826071215 | |
| 013 | 实验动物中心 | https://sydwzx.cqmu.edu.cn | 109180604@qq.com | 023-63316775 |
| 014 | 感染性疾病分子生物学重点实验室 | https://lipid.cqmu.edu.cn/ | t6sys@163.com | 023-68486780 |
| 015 | 生命科学研究院 | https://sky.cqmu.edu.cn/xwgg/tzgg.htm | sky@cqmu.edu.cn | 023-63664820 |
| 016 | 护理学院 | https://nursing.cqmu.edu.cn/ | Yanhan@hospital.cqmu.edu.cn | 023-68481815 |
| 017 | 马克思主义学院 | https://sxzzjyxy.cqmu.edu.cn/ | 1241160357@qq.com | 023-68485573 |
| 018 | 第四临床学院 | http://www.uhcmu.com/xxfb/tzgg.htm | 819236767@qq.com | 023-65715630 |
| 019 | 外国语学院 | https://foreign.cqmu.edu.cn/ | 4559167@qq.com | 023-68485242 023-65714456 |
| 020 | 医学信息学院 | https://mi.cqmu.edu.cn/ | 624728231@qq.com | 023-65714685 |
| 022 | 第三临床学院 | www.3-hospital-cqmu.com | 75696399@qq.com | 023-67167736 023-67455197 |
| 023 | 附属康复医院 | http://www.rhcqmu.com/pc/lists/news/s/cid/99 | fskfyykjk@163.com | 023-68088701 |
| 025 | 国科大（重庆学院） | http://www.cigit.cas.cn/ | gkdcqyyyyb@163.com | 023-63390004 |
