“中国一流研究生院”应具有“一流的导师队伍、一流的教学水平、一流的科研成果、一流的国际影响”。结合2016年中国普通高校研究生教育竞争力排行榜和中国研究生院竞争力排行榜的结果，选取全部580个研究生培养单位中竞争力排名前5%的单位，作为“中国一流研究生院”，共评选出29所研究生培养单位(表1)。
结果显示：中国科学院大学的研究生教育水平在全国遥遥领先，北京大学、清华大学、浙江大学、上海交通大学、复旦大学紧随其后。武汉大学位列全国第7，华中科技大学排名全国第11。
表1 2016年中国一流研究生院竞争力排行榜
| 排名 | 单位名称 | 总分 | 地区内序 | 类型序 | ||
| 1 | 中国科学院大学 | 100.00 | 北京市 | 1 | 理工 | 1 |
| 2 | 北京大学 | 92.93 | 北京市 | 2 | 综合 | 1 |
| 3 | 清华大学 | 88.95 | 北京市 | 3 | 理工 | 2 |
| 4 | 浙江大学 | 87.44 | 浙江省 | 1 | 综合 | 2 |
| 5 | 上海交通大学 | 86.55 | 上海市 | 1 | 综合 | 3 |
| 6 | 复旦大学 | 85.56 | 上海市 | 2 | 综合 | 4 |
| 7 | 武汉大学 | 82.72 | 湖北省 | 1 | 综合 | 5 |
| 8 | 四川大学 | 81.29 | 四川省 | 1 | 综合 | 6 |
| 9 | 中山大学 | 77.83 | 广东省 | 1 | 综合 | 7 |
| 10 | 南京大学 | 77.46 | 江苏省 | 1 | 综合 | 8 |
| 11 | 华中科技大学 | 76.02 | 湖北省 | 2 | 理工 | 3 |
| 12 | 吉林大学 | 73.65 | 吉林省 | 1 | 综合 | 9 |
| 13 | 山东大学 | 73.61 | 山东省 | 1 | 综合 | 10 |
| 14 | 中南大学 | 72.65 | 湖南省 | 1 | 综合 | 11 |
| 15 | 中国科学技术大学 | 70.47 | 安徽省 | 1 | 理工 | 4 |
| 16 | 哈尔滨工业大学 | 69.81 | 黑龙江省 | 1 | 理工 | 5 |
| 17 | 西安交通大学 | 69.25 | 陕西省 | 1 | 理工 | 6 |
| 18 | 大连理工大学 | 68.97 | 辽宁省 | 1 | 理工 | 7 |
| 19 | 中国人民大学 | 66.94 | 北京市 | 4 | 文法 | 1 |
| 20 | 同济大学 | 66.20 | 上海市 | 3 | 理工 | 8 |
| 21 | 厦门大学 | 65.48 | 福建省 | 1 | 综合 | 12 |
| 22 | 南开大学 | 65.15 | 天津市 | 1 | 综合 | 13 |
| 23 | 东南大学 | 65.13 | 江苏省 | 2 | 理工 | 9 |
| 24 | 北京师范大学 | 65.12 | 北京市 | 5 | 师范 | 1 |
| 25 | 华南理工大学 | 64.22 | 广东省 | 2 | 理工 | 10 |
| 26 | 天津大学 | 61.03 | 天津市 | 2 | 理工 | 11 |
| 27 | 北京航空航天大学 | 59.94 | 北京市 | 6 | 理工 | 12 |
| 28 | 北京理工大学 | 59.63 | 北京市 | 7 | 理工 | 13 |
| 29 | 华东师范大学 | 59.36 | 上海市 | 4 | 师范 | 2 |
