2016年9月5日，由中国科学评价研究中心（RCCSE）、中国科教评价网（www.nseac.com）和武汉大学中国教育质量评价中心（ECCEQ）共同发布了2016年中国研究生教育排行榜，其中包括中国研究生教育按31个省、市、自治区（未含港澳台地区），按62个研究生院，按574所高校（含分省、分类型），按12个学科门类，按96个一级学科，按394个专业（学术型）和38个专业学位一级学科的排名。共发布540多个不同层次、不同角度的排行榜。

排名	研究生院名称	总分	办学资源序	教研产出序	质量与影响序	省市	序	类型	序	去年排名
1	中国科学院大学研究院	100.00				北京	1	理工	1	1
2	北京大学研究生院	92.93				北京	2	综合	1	2
3	清华大学研究生院	88.95				北京	3	理工	2	4
4	浙江大学研究生院	87.44				浙江	1	综合	2	3
5	上海交通大学研究生院	86.55				上海	1	综合	3	5
6	复旦大学研究生院	85.56				上海	2	综合	4	7
7	武汉大学研究生院	82.72				湖北	1	综合	5	6
8	四川大学研究生院	81.29				四川	1	综合	6	9
9	中山大学研究生院	77.83				广东	1	综合	7	12
10	南京大学研究生院	77.46				江苏	1	综合	8	10
11	华中科技大学研究生院	76.02				湖北	2	理工	3	8
12	吉林大学研究生院	73.65				吉林	1	综合	9	11
13	山东大学研究生院	73.61				山东	1	综合	10	13
14	中南大学研究生院	72.65				湖南	1	综合	11	15
15	中国科学技术大学研究生院	70.47				安徽	1	理工	4	16
16	哈尔滨工业大学研究生院	69.81				黑龙江	1	理工	5	14
17	西安交通大学研究生院	69.25				陕西	1	理工	6	17
18	大连理工大学研究生院	68.97				辽宁	1	理工	7	22
19	中国人民大学研究生院	66.94				北京	4	文法	1	18
20	同济大学研究生院	66.20				上海	3	理工	8	19
21	厦门大学研究生院	65.48				福建	1	综合	12	24
22	南开大学研究生院	65.15				天津	1	综合	13	23
23	东南大学研究生院	65.13				江苏	2	理工	9	20
24	北京师范大学研究生院	65.12				北京	5	师范	1	27
25	华南理工大学研究生院	64.22				广东	2	理工	10	25
26	天津大学研究生院	61.03				天津	2	理工	11	21
27	北京航空航天大学研究生院	59.94				北京	6	理工	12	26
28	北京理工大学研究生院	59.63				北京	7	理工	13	29
29	华东师范大学研究生院	59.36				上海	4	师范	2	33
30	重庆大学研究生院	59.03				重庆	1	理工	14	28
31	中国农业大学研究生院	58.56				北京	8	农林	1	30
32	湖南大学研究生院	57.78				湖南	2	理工	15	32
33	西北工业大学研究生院	56.93				陕西	2	理工	16	34
34	兰州大学研究生院	56.76				甘肃	1	综合	14	31
35	华东理工大学研究生院	56.50				上海	5	理工	17	37
36	南京航空航天大学研究生院	55.67				江苏	3	理工	18	40
37	南京农业大学研究生院	55.44				江苏	4	农林	2	39
38	电子科技大学研究生院	55.27				四川	2	理工	19	35
39	东北大学研究生院	55.08				辽宁	2	理工	20	36
40	北京科技大学研究生院	54.48				北京	9	理工	21	38
41	东北师范大学研究生院	54.42				吉林	2	师范	3	44
42	南京理工大学研究生院	53.93				江苏	5	理工	22	43
43	北京交通大学研究生院	53.87				北京	10	理工	23	42
44	西南交通大学研究生院	53.86				四川	3	理工	24	45
45	河海大学研究生院	53.03				江苏	6	理工	25	41
46	西北农林科技大学研究生院	52.52				陕西	3	农林	3	47
47	西安电子科技大学研究生院	52.32				陕西	4	理工	26	46
48	哈尔滨工程大学研究生院	51.50				黑龙江	2	理工	27	48
49	中国农业科学院研究生院	51.41				北京	11	农林	4	51
50	中国矿业大学(徐州)研究生院	51.38				江苏	7	理工	28	54
51	中国地质大学(武汉)研究生院	49.50				湖北	3	理工	29	53
52	北京协和医学院研究生院	49.12				北京	12	医药	1	49
53	北京邮电大学研究生院	48.59				北京	13	理工	30	50
54	中国石油大学(北京)研究生院	48.51				北京	14	理工	31	55
55	中国社会科学院研究生院	48.32				北京	15	文法	2	52
56	中国地质大学(北京)研究生院	48.25				北京	16	理工	32	56
57	中国石油大学(华东)研究生院	47.97				山东	2	理工	33	57
58	北京林业大学研究生院	47.96				北京	17	农林	5	58
59	中国矿业大学(北京)研究生院	47.62				北京	18	理工	34	59
60	中国地质科学院研究生部	43.72				北京	19	理工	35	61
61	中国中医科学院研究生院	41.75				北京	20	医药	2	60
62	中国林业科学研究院研究生部	38.52				北京	21	农林	6	62